El valiente ninja de Kioto debe ingresar al castillo protegido y robar de allí un artefacto, que en un momento le robó a su templo su orden. Tú en el juego Jump Ninja Hero se unirá a sus aventuras. Para llegar al castillo, nuestro héroe necesita atravesar una determinada área, que está custodiada por soldados enemigos. Por nuestro héroe disparará constantemente desde arcos, ballestas y otras armas. Usted está conduciendo, nuestro héroe tendrá que esquivar todos los objetos voladores en él. Solo para que pueda sobrevivir y alcanzar el punto final de su viaje.