Últimamente inquietos en Manhattan, había muchos mutantes y alguien detrás de ellos. Un equipo de tortugas ya había frustrado varios planes malvados y el enemigo invisible decidió vengarse cruelmente secuestrando a su sensei. Selecciona el personaje que primero va a la batalla con los mutantes. Leonardo es el maestro de las peleas katan, el líder del equipo Raphael maneja hábilmente a los Sayes, Donethello usa un bastón especial y Michelangelo prefiere el nunchaku. Se les ayudará en abril, ella posee con maestría un bate de béisbol mágico verde.