Un valiente ninja llamado Kyoto debe trepar al techo de un edificio alto. Tú en el juego Ninja Up ayudarás al personaje en esta aventura. Frente a ti, tu ninja parado en el suelo será visible en la pantalla. En una señal, tu personaje comenzará a saltar a cierta altura. Deberá dibujar una línea debajo del ninja con el mouse. Tan pronto como lo dibujes, aparecerá una cuerda de goma especial. Tu héroe, al caer sobre él, dará un salto y volará. Entonces, al dibujar estas cuerdas en el juego Ninja Up, ayudarás gradualmente al héroe a subir al techo del edificio. Al mismo tiempo, en el camino, deberás ayudar al ninja a recolectar elementos que colgarán en el aire en varios lugares del campo de juego. Por su selección en el juego Ninja Up te dará puntos.