Nuestro resistente plomero llamado Mario ha sido transportado a través de un portal a la misteriosa isla de Yoshi's Island. Ahora nuestro héroe tendrá que encontrar el camino a casa. Mario será visible en la pantalla frente a ti, quien, bajo tu liderazgo, avanzará a través de la ubicación. En el camino, recogerá monedas de oro y otros artículos esparcidos por todas partes. En el camino, le esperan fallas en el suelo, obstáculos y otros peligros. Algunos de ellos tu héroe podrá eludirlos, a través de otros peligros que simplemente puede saltar. Al final de cada nivel en Yoshi's Island, te estará esperando un portal que te llevará al siguiente nivel.